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MEET: Motif Elements Estimation Toolki

Autor
Pairó, E.; Maynou, J.; Vallverdu, M.; Gallardo, J.; Caminal, P.; Marco, S.; Perera, A.
Tipus d'activitat
Presentació treball a congrés
Nom de l'edició
XXVIII Congreso Anual de la Sociedad Española de Ingeniería Biomédica (CASEIB 2010)
Any de l'edició
2010
Data de presentació
2010-11-18
Llibre d'actes
Libro de actas: CASEIB 2010: Congreso Anual de la Sociedad Española de Ingeniería Biomédica
Repositori
http://hdl.handle.net/2117/14463 Obrir en finestra nova
Resum
MEET (Motif Elements Estimation Toolkit) es un paquete en R que integra un conjunto de algoritmos para la detección computacional de los puntos de unión de los factores de transcripción (TFBS). El paquete en R MEET incluye cinco programas de búsqueda de motivos: MEME/MAST (Multiple Expectation-Maximization for Motif Elicitation), Q-residuals, MDscan (Motif Discovery scan), ITEME (Information Theory Elements for Motif Estimation) y Match. Además, permite al usuario trabajar con diferentes al...
Citació
Pairó, E. [et al.]. MEET: Motif Elements Estimation Toolki. A: Congreso Anual de la Sociedad Española de Ingeniería Biomédica (CASEIB 2010). "Libro de Actas del XXVIII Congreso Anual de la Sociedad Española de Ingeniería Biomédica (CASEIB 2010)". Madrid: 2010.
Grup de recerca
B2SLab - Bioinformatics and Biomedical Signals Laboratory
CREB - Centre de Recerca en Enginyeria Biomedica

Participants

Arxius