Carregant...
Carregant...

Vés al contingut (premeu Retorn)

BIOCOM-SC - Grup de Biologia Computacional i Sistemes Complexos

Total activitats: 1274
Tipus
Grup de recerca
Tipus de grup
Grup de recerca UPC
Acrònim
BIOCOM-SC
URL
http://biocomsc.upc.edu Obrir en finestra nova
Objectius
El grup de recerca BIOCOM-SC sorgeix de la unió de dos grups consolidats anteriors, un centrat en física no lineal i de sistemes complexos i l’altre en simulació de sistemes biològics. El grup resultant aspira a crear sinergies de manera que els coneixements de física bàsica (fluids, materials, sistemes complexos) s’utilitzin per abordar problemes en biociència, des d’aquells d’interès en biomedicina (dinàmica d’ones elèctriques al cor, xarxes neuronals, tuberculosi) a d’altres d’enginyeria de sistemes biològics (simulació de sistemes microbians d’interès agroalimentari i medi ambiental). Per assolir aquest objectiu comptem amb un grup interdisciplinari on a més de físics hi ha matemàtics, enginyers i biòlegs, en col·laboració amb grups de biologia experimental de dins i fora de Catalunya. L’objectiu final és esdevenir un grup de referència en biologia teòrica i computacional capaç de fer el salt des de les idees de física fonamental a problemes d’interès biosanitari o mediambiental.
Paraules clau
Biologia computacional, Biofísica, Biomedicina, Física no lineal, Sistemes complexos
Completa aquestes dades (només responsables)

Producció científica

1 a 50 de 1274 resultats
 
  • From cell polarization to random crawling of individual amoebas

     Alonso, S.
    International Conference Engineering of Chemical Complexity
    p. 26
    Data de presentació: 2017-06-19
    Presentació treball a congrés
  • Bubble control by means of a piezoelectric device at cryogenic conditions

     Gonzalez, R.; Garcia, J. E.; Ochoa, D. A.
    Projecte R+D+I competitiu
  • Presence of listeria monocytogenes in prepared foods: analysis of influencing factors

     Carbó, R.; del Valle, LJ.
    Journal of food processing and preservation
    Vol. 41, num. 2
    DOI: 10.1111/jfpp.12842
    Data de publicació: 2017-04
    Article en revista
  • Nonlinear signaling on biological networks: The role of stochasticity and spectral clustering

     Hernadez-Hernandez, G.; Myers, J.; Alvarez-Lacalle, E.; Shiferaw, Y.
    Physical review E
    Vol. 95, num. 3
    DOI: 10.1103/PhysRevE.95.032313
    Data de publicació: 2017-03-13
    Article en revista
  • Developing an individual-based model to study the bacterial denitrification process

     Araujo, P.
    Departament d'Enginyeria Agroalimentària i Biotecnologia, Universitat Politècnica de Catalunya
    Tesi doctoral
  • An experimental study of ultrasonic vibration and the penetration of granular material

     Firstbrook, D.; Worrall, K.; Timoney, R.; Suñol, F.; Gao, Y.; Harkness, P.
    Proceedings of the Royal Society A. Mathematical physical and engineering sciences
    Vol. 473, num. 2198, p. 1-16
    DOI: 10.1098/rspa.2016.0673
    Data de publicació: 2017-02-01
    Article en revista
  • Modelling random crawling, membrane deformation and biochemical patterns in amoeba

     Alonso, S.; Beta, C.
    Biology for Physics Conference: Is there new Physics in Living Matter?
    Data de presentació: 2017-01-16
    Presentació treball a congrés
  • Numerical Study and Experimental Comparison of Two-Phase Flow Generation in a T-Junction

     Arias, S.; Montlaur, A.
    AIAA journal
    Vol. 55, num. 2, p. 1565-1574
    DOI: 10.2514/1.J055387
    Data de publicació: 2017
    Article en revista
  • Imatge
  • Control acústico de la ebullición en depósitos de combustible en microgravedad

     Gonzalez, R.; Arias, S.; Legendre, D.; Colin, C.; Muratov, C.; Khasin, M.
    Projecte R+D+I competitiu
  • Acoustic evaluation of modular greenery noise barriers  Accés obert

     Lacasta, A.M; Peñaranda, A.; Rodriguez Cantalapiedra, I.; Auguet, C.; Burés, S.; Urrestarazu, M.
    Urban forestry and urban greening
    Vol. 20, num. December, p. 172-179
    DOI: 10.1016/j.ufug.2016.08.010
    Data de publicació: 2016-12-01
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Reentry and ectopic pacemakers emerge in a three-dimensional model for a slab of cardiac tissue with diffuse microfibrosis near the percolation threshold  Accés obert

     Alonso, S.; Weber, R.; Bär, M.
    PLoS one
    Vol. 11, num. 11, p. 1-23
    DOI: 10.1371/journal.pone.0166972
    Data de publicació: 2016-11-22
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Cinda en 100 palabras

     Giro, A.
    Data de publicació: 2016-10-31
    Capítol de llibre
  • Bubble management by means of acoustic fields

     Garcia-Sabaté, A.; Gonzalez, R.
    International Conference on Two-Phase Systems for Space and Ground Applications
    Data de presentació: 2016-09-27
    Presentació treball a congrés
  • Analysis of the characteristic lengths in the bubble and slug flow regimes generated in a capillary T-junction

     Arias, S.; Gonzalez, R.
    International journal of multiphase flow
    Vol. 87, p. 167-174
    DOI: 10.1016/j.ijmultiphaseflow.2016.09.011
    Data de publicació: 2016-09-20
    Article en revista
  • Modeling internal concentration gradients in cell polarity: interplay between kinases and phosphatases

     Alonso, S.
    International conference in Systems Biology
    Data de presentació: 2016-09-19
    Presentació treball a congrés
  • Onset of mechanochemical pattern formation in simple models of viscoelastic active cytoplasm

     Alonso, S.
    BCAM Workshop on Nonlinear Dynamics in Biological Systems
    p. 19
    Data de presentació: 2016-09-02
    Presentació treball a congrés
  • Pro-arrhythmic effects of cardiac contraction

     Echebarria, B.
    BCAM Workshop on Nonlinear Dynamics in Biological Systems
    p. 13
    Data de presentació: 2016-09-02
    Presentació treball a congrés
  • Nonlinear physics of electrical wave propagation in the heart: a review  Accés obert

     Alonso, S.; Baer, M.; Echebarria, B.
    Reports on progress in physics
    Vol. 79, num. 9, p. 096601-096700
    DOI: 10.1088/0034-4885/79/9/096601
    Data de publicació: 2016-08-12
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Calcium alternans as a critical order-disorder transition

     Alvarez-Lacalle, E.; Echebarria, B.; Spalding, J.; Shiferaw, Y.
    SIAM Conference on the Life Sciences
    Data de presentació: 2016-07-11
    Presentació treball a congrés
  • Influence of gap junction dynamics on the stability of reentrant waves in cadiac tissue  Accés obert

     Hawks, C.; Elorza, J.; Echebarria, B.; Rodriguez Cantalapiedra, I.; Peñaranda, A.; Bragard, J.
    Computing in Cardiology Annual Conference
    p. 437-440
    Data de presentació: 2016-07-07
    Presentació treball a congrés
    Accés al text complet
  • Una activitat docent per introduir la programació lineal en estudis d’Enginyeria de Biosistemes i Agroalimentària a través de problemes de dietes, planificació i produccions  Accés obert

     Blanco, M.; Ginovart, M.
    Congrès Català d'Educació Matemàtica
    p. 1-10
    Data de presentació: 2016-07
    Presentació treball a congrés
    Accés al text complet
  • Effects of vibrations applied to fluids at different gravity levels  Accés obert

     Garcia-Sabaté, A.
    Departament de Física, Universitat Politècnica de Catalunya
    Tesi doctoral
  • New model approach for forecasting timing of weed control measures

     Izquierdo, J.; Morrisson, J.; Prats, C.; Lopez, D.
    International Weed Science Congress
    p. 62-
    Data de presentació: 2016-06-20
    Presentació treball a congrés
  • A 3D CFD numerical study of the bubble generation process into a bubble Tjunction generator and its comparison with experimental data: Part II  Accés obert

     Arias, S.; Montlaur, A.
    European Conference on Computational Mechanics
    p. 1
    Data de presentació: 2016-06-08
    Presentació treball a congrés
    Accés al text complet
  • Statistical physics of active ionic channels

     Ramirez de La Piscina, L.; Sancho, J M
    NoLineal - International Conference on Nonlinear Mathematics and Physics
    p. 50
    Data de presentació: 2016-06-08
    Presentació treball a congrés
  • A 3D CFD numerical study of the bubble generation process into a bubble Tjunction generator and its comparison with experimental data: Part I  Accés obert

     Arias, S.; Montlaur, A.
    European Conference on Computational Mechanics
    p. 772-787
    Data de presentació: 2016-06-08
    Presentació treball a congrés
    Accés al text complet
  • A 3D numerical study of the bubble generation process into a bubble T-junction generator and its comparison with experimental data: part I

     Arias, S.; Montlaur, A.
    European Conference on Computational Mechanics
    p. 772-787
    Data de presentació: 2016-06-06
    Presentació treball a congrés
  • Development of new device for measuring the thermal conductivity of polymeric nanocomposite materials

     Gannoum, M.; Kostoglou, M.; Gonzalez, R.; Karapantsios, T.
    Smart and Green Interfaces Conference
    p. 146
    Data de presentació: 2016-05-05
    Presentació treball a congrés
  • Oscillations and uniaxial mechanochemical waves in a model of an active poroelastic medium: application to deformation patterns in protoplasmic droplets of Physarum polycephalum  Accés obert

     Alonso, S.; Strachauer, U.; Radszuweit, M.; Bär, M.; Hauser, M.
    Physica. D, Nonlinear phenomena
    Vol. 318-319, p. 58-69
    DOI: 10.1016/j.physd.2015.09.017
    Data de publicació: 2016-04-01
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Accés al text complet
  • Reactive interstitial and reparative fibrosis as substrates for cardiac ectopic pacemakers and reentries  Accés obert

     sachetto, R.; Gouvêa, B.; Moreira, J.; Lobosco, M.; Alonso, S.; Bär, M.; Weber, R.
    DOI: 10.1007/978-3-319-31744-1_31
    Data de publicació: 2016-03-25
    Capítol de llibre
    Accés al text complet
  • Development and application of atrial myocyte models to investigate mechanisms that confer patients a high risk of atrial fibrillationda

     Echebarria, B.; Alvarez-Lacalle, E.; Peñaranda, A.; Rodriguez Cantalapiedra, I.; Alonso, S.; Shiferaw, Y.; Marchena, M.
    Projecte R+D+I competitiu
  • Evaluación de tres protocolos de extracción proteica para la identificación de micobacterias por espectrometría de masas (MALDI-TOF)  Accés obert

     Struzka, E.; Fernández Gil, R.; Prats, C.; Alcaide Fernández de Vega, F.
    Científica TSS
    Vol. 4, p. 15-17
    Data de publicació: 2016-03-01
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Mechanisms Underlying Electro-Mechanical Cardiac Alternans

     Echebarria, B.; Alvarez-Lacalle, E.; Rodriguez Cantalapiedra, I.; Peñaranda, A.
    DOI: 10.1007/978-3-319-33054-9_6
    Data de publicació: 2016-02-29
    Capítol de llibre
    Imatge
  • Pattern formation at cellular membranes by phosphorylation and dephosphorylation of proteins

     Alonso, S.
    DOI: 10.1007/978-3-319-33054-9_6
    Data de publicació: 2016-02-29
    Capítol de llibre
    Imatge
  • Local inflammation, dissemination and coalescence of lesions are key for the progression toward active tuberculosis: the bubble model  Accés obert

     Prats, C.; Vilaplana, C.; Valls, J.; Marzo, E.; Cardona, P.J.; Lopez, D.
    Frontiers in Microbiology
    Vol. 7, p. 33-
    DOI: 10.3389/fmicb.2016.00033
    Data de publicació: 2016-02-02
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Nucleation of calcium waves in cardiac cells: the role of network connectivity

     Hernadez-Hernandez, G.; Shiferaw, Y.; Alvarez-Lacalle, E.
    Biophysical journal
    Vol. 110, num. 3 Sup1, p. 435-
    DOI: 10.1016/j.bpj.2015.11.2347
    Data de publicació: 2016-02
    Article en revista
  • Sistemas físicos y biofísicos complejos: hacia una visió global de su dinámica y fluctuaciones

     Masoller, C.; Ramirez de La Piscina, L.; Torrent, M.C.; Peñaranda, A.; Pigolotti, S.; Pons, A. J.; Cencini, M.; Meca, E.
    Projecte R+D+I competitiu
  • Individual-based modeling of tuberculosis in a user-friendly interface: Understanding the epidemiological role of population heterogeneity in a city  Accés obert

     Prats, C.; Montañola-Sales, C.; Gilabert, JF; Valls, J.; Casanovas, J.; Vilaplana, C.; Cardona, P.J.; Lopez, D.
    Frontiers in Microbiology
    Vol. 6:1564
    DOI: 10.3389/fmicb.2015.01564
    Data de publicació: 2016-01-01
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Hydrological soil behavior in areas with semi-arid vegetation (Beni Chougrane Mountains, Algeria)  Accés obert

     Boukhari, Y.; Ginovart, M.; Verdu, AMC.; Mas, M.T.; Mederbal, K.; Josa, R.
    Biología
    Vol. 71, num. 10, p. 1131-1136
    DOI: 10.1515/biolog-2016-0132
    Data de publicació: 2016
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Modelización de crecimientos microbianos en medios heterogéneos y de movilidad reducida  Accés obert

     Font, M.; Ginovart, M.
    Modelling in science education and learning
    Vol. 9, num. 2, p. 81-120
    DOI: 10.4995/msel.2016.5789
    Data de publicació: 2016
    Article en revista
    Accés al text complet
  • MbT-Tool: An open-access tool based on thermodynamic electron equivalents model to obtain microbial-metabolic reactions to be used in biotechnological process

     Araujo, P.; Gras, A.; Ginovart, M.
    Computational and structural biotechnology journal
    Vol. 14, p. 325-332
    DOI: 10.1016/j.csbj.2016.08.001
    Data de publicació: 2016
    Article en revista
  • INDISIM-Paracoccus, an individual-based and thermodynamic model for a denitrifying bacterium  Accés obert

     Araujo, P.; Gras, A.; Ginovart, M.
    Journal of theoretical biology
    Vol. 403, p. 45-58
    DOI: 10.1016/j.jtbi.2016.05.017
    Data de publicació: 2016
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Hydrological soil behavior in Beni Chougrane Mountains (Algeria)

     Boukhari, Y.; Ginovart, M.; Verdu, AMC.; Mas, M.T.; Mederbal, K.; Josa, R.
    International Conference on Biohydrology
    p. 89
    Data de presentació: 2016
    Presentació treball a congrés
  • Mass degradation to reduce cytotoxic products as an individual behavior-rule embedded in a microbial model for the study of the denitrification process

     Araujo, P.; Gras, A.; Ginovart, M.
    International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology
    p. 653
    Data de presentació: 2016
    Presentació treball a congrés
  • Towards an individual-based simulator of the yeast saccharomyces cerevisiae for the food science with predictive capabilities

     Portell, X.; Ginovart, M.
    International conference on simulation and modelling in the food and bio-industry
    p. 83-87
    Data de presentació: 2016
    Presentació treball a congrés