Carregant...
Carregant...

Vés al contingut (premeu Retorn)

BIOCOM-SC - Grup de Biologia Computacional i Sistemes Complexos

Total activitats: 1300
Tipus
Grup de recerca
Tipus de grup
Grup de recerca UPC
Acrònim
BIOCOM-SC
URL
http://biocomsc.upc.edu Obrir en finestra nova
Objectius
El grup de recerca BIOCOM-SC sorgeix de la unió de dos grups consolidats anteriors, un centrat en física no lineal i de sistemes complexos i l’altre en simulació de sistemes biològics. El grup resultant aspira a crear sinergies de manera que els coneixements de física bàsica (fluids, materials, sistemes complexos) s’utilitzin per abordar problemes en biociència, des d’aquells d’interès en biomedicina (dinàmica d’ones elèctriques al cor, xarxes neuronals, tuberculosi) a d’altres d’enginyeria de sistemes biològics (simulació de sistemes microbians d’interès agroalimentari i medi ambiental). Per assolir aquest objectiu comptem amb un grup interdisciplinari on a més de físics hi ha matemàtics, enginyers i biòlegs, en col·laboració amb grups de biologia experimental de dins i fora de Catalunya. L’objectiu final és esdevenir un grup de referència en biologia teòrica i computacional capaç de fer el salt des de les idees de física fonamental a problemes d’interès biosanitari o mediambiental.
Completa aquestes dades (només responsables)

Producció científica

1 a 50 de 1300 resultats
 
  • A microfluidics and agent-based modeling framework for investigating spatial organization in bacterial colonies: the case of Pseudomonas Aeruginosa and H1-Type VI secretion interactions  Accés obert

     Wilmoth, J.; Doak, P.; Timm, A.; Halsted, M.; Anderson, J.; Ginovart, M.; Prats, C.; Portell, X.; Retterer, S.; Fuentes-Cabrera, M.
    Frontiers in Microbiology
    Vol. 9, num. 33, p. 1-11
    DOI: 10.3389/fmicb.2018.00033
    Data de publicació: 2018-02-06
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Digital image analysis of yeast single cells growing in two different oxygen concentrations to analyze the population growth and to assist individual-based modeling

     Ginovart, M.; Carbó, R.; Blanco, M.; Portell, X.
    Frontiers in Microbiology
    Vol. 8, p. 2628-
    DOI: 10.3389/fmicb.2017.02628
    Data de publicació: 2018-01-04
    Article en revista
  • From genes to ecosystems in microbiology: modeling approaches and the importance of individuality  Accés obert

     Kreft, J.U.; Plugge, C.M.; Prats, C.; Leveau, J.H.J.; Zhang, W.; Hellweger, F.L.
    Frontiers in Microbiology
    Vol. 8, p. 1-23
    DOI: 10.3389/fmicb.2017.02299
    Data de publicació: 2017-11-27
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Mechanochemical pattern formation in simple models of active viscoelastic fluids and solids  Accés obert

     Alonso, S.; Radszuweit, M.; Engel, H.; Baer, M.
    Journal of physics D. Applied physics
    Vol. 50, num. 43, p. 434004-1-434004-16
    DOI: 10.1088/1361-6463/aa8a1d
    Data de publicació: 2017-11-01
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Low Weber number jet collision regimes in microgravity

     Suñol, F.; Gonzalez, R.
    Physics of fluids
    Vol. 29, num. 11, p. 2-6
    DOI: 10.1063/1.5011973
    Data de publicació: 2017-11-01
    Article en revista
  • Control of electrical turbulence by periodic excitation of cardiac tissue  Accés obert

     Buran, P.; Bär, M.; Alonso, S.; Niedermayer, T.
    Chaos : an interdisciplinary journal of nonlinear science
    Vol. 27, num. 11, p. 113110-1-113110-9
    DOI: 10.1063/1.5010787
    Data de publicació: 2017-11-01
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Microbiological quality of seaweed Ulva ohnoi growthn on integrated recirculating system and epiphytic bacteria isolation

     Oca, J.; Masaló, I.; Naves, B.; Machado, S.; Jimenez, P.; Carbó, R.; Pintado, J.; Cremades, J.
    Aquaculture Europe
    p. 838-839
    Data de presentació: 2017-10
    Presentació treball a congrés
  • Effects of small conductance calcium activated potassium channels in atrial myocytes

     Peñaranda, A.; Echebarria, B.; Alvarez-Lacalle, E.; Rodriguez Cantalapiedra, I.
    CNIC Conference Atrial Fibrillation Symposium
    p. 28
    Data de presentació: 2017-09-24
    Presentació treball a congrés
  • Minimal model for calcium alternans due to SR release refractoriness  Accés obert

     Rodriguez Cantalapiedra, I.; Alvarez-Lacalle, E.; Peñaranda, A.; Echebarria, B.
    Chaos : an interdisciplinary journal of nonlinear science
    Vol. 27, num. 9, p. 093928-1-093928-13
    DOI: 10.1063/1.5000709
    Data de publicació: 2017-09-07
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Impact study of contact angle boundary conditions for CFD simulation of two-phase flow generation in a T-junction

     Arias, S.; Montlaur, A.
    7th International Workshop on Bubble and Drop Interfaces (B&D 2017)
    p. 91
    Data de presentació: 2017-07-26
    Presentació treball a congrés
  • Development of a computational model of calcium signaling in cardiac cells at the submicron scale

     Marchena, M.; Echebarria, B.
    International Conference Engineering of Chemical Complexity
    p. 57-
    Data de presentació: 2017-06-20
    Presentació treball a congrés
  • From cell polarization to random crawling of individual amoebas

     Alonso, S.
    International Conference Engineering of Chemical Complexity
    p. 26
    Data de presentació: 2017-06-19
    Presentació treball a congrés
  • Medidas acústicas del ruido producido por bajantes de desagüe en una vivienda y realización del informe correspondiente

     Peñaranda, A.; Lacasta, A.M; Auguet, C.; Rodriguez Cantalapiedra, I.
    Data: 2017-06-02
    Document cientificotècnic
  • Bubble control by means of a piezoelectric device at cryogenic conditions

     Gonzalez, R.; Garcia, J. E.; Ochoa, D. A.
    Projecte R+D+I competitiu
  • The malaria system microApp: A new, mobile device-based tool for malaria diagnosis  Accés obert

     Oliveira, A.; Prats, C.; Espasa, M.; Zarzuela, F.; Montañola-Sales, C.; Silgado, A.; Lopez, D.; Erruda, M.; Gómez, J.; Albuquerque, J.
    JMIR Research Protocols
    Vol. 6, num. 4, p. e70-
    DOI: 10.2196/resprot.6758
    Data de publicació: 2017-04-25
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Automatic segmentation of Z-lines in cardiac cells from microscope fluorescence images

     Nolla, C.; Vallmitjana, A.; Marchena, M.; Echebarria, B.; Herraiz, A.; Hove-Madsen, L.; Wayne Chen, S.R.; Benitez, R.
    Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society
    Data de presentació: 2017-04-14
    Presentació treball a congrés
  • Ruido producido por la cabina de Proyección de cine Ful-HD del centro comercial Splau

     Peñaranda, A.; Auguet, C.; Rodriguez Cantalapiedra, I.; Lacasta, A.M
    Data: 2017-04-06
    Document cientificotècnic
  • Presence of listeria monocytogenes in prepared foods: analysis of influencing factors  Accés obert

     Carbó, R.; del Valle, LJ.
    Journal of food processing and preservation
    Vol. 41, num. 2
    DOI: 10.1111/jfpp.12842
    Data de publicació: 2017-04
    Article en revista
  • Development of a computational model of calcium signaling in cardiac cells at the submicron scale

     Marchena, M.; Echebarria, B.
    Congreso de Física Estadística
    p. 162-
    Data de presentació: 2017-03-31
    Presentació treball a congrés
  • Nonlinear signaling on biological networks: The role of stochasticity and spectral clustering  Accés obert

     Hernadez-Hernandez, G.; Myers, J.; Alvarez-Lacalle, E.; Shiferaw, Y.
    Physical review E
    Vol. 95, num. 3
    DOI: 10.1103/PhysRevE.95.032313
    Data de publicació: 2017-03-13
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Developing an individual-based model to study the bacterial denitrification process  Accés obert

     Araujo, P.
    Departament d'Enginyeria Agroalimentària i Biotecnologia, Universitat Politècnica de Catalunya
    Tesi doctoral
    Accés al text complet
  • An experimental study of ultrasonic vibration and the penetration of granular material  Accés obert

     Firstbrook, D.; Worrall, K.; Timoney, R.; Suñol, F.; Gao, Y.; Harkness, P.
    Proceedings of the Royal Society A. Mathematical physical and engineering sciences
    Vol. 473, num. 2198, p. 1-16
    DOI: 10.1098/rspa.2016.0673
    Data de publicació: 2017-02-01
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Modelling random crawling, membrane deformation and biochemical patterns in amoeba

     Alonso, S.; Beta, C.
    Biology for Physics Conference: Is there new Physics in Living Matter?
    Data de presentació: 2017-01-16
    Presentació treball a congrés
  • Imatge
  • Numerical Study and Experimental Comparison of Two-Phase Flow Generation in a T-Junction  Accés obert

     Arias, S.; Montlaur, A.
    AIAA journal
    Vol. 55, num. 2, p. 1565-1574
    DOI: 10.2514/1.J055387
    Data de publicació: 2017
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Using archaeomagnetism to improve the dating of three sites in Catalonia (NE Spain)

     Casas, Ll.; Auguet, C.; Cantoni, G.; López, J.; Guasch, N.; Prevosti, M.
    Journal of cultural heritage
    DOI: 10.1016/j.culher.2017.11.004
    Data de publicació: 2017-01-01
    Article en revista
  • Effects of small conductance calcium activated potassium channels in cardiac myocytes

     Peñaranda, A.; Echebarria, B.; Alvarez-Lacalle, E.; Rodriguez Cantalapiedra, I.
    Computers in Cardiology
    Data de publicació: 2017
    Article en revista
  • How a multi-agent programmable modelling environment like NetLogo can help to deal with communities or assemblages of bacteria on surfaces?

     Ginovart, M.
    International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology
    p. 303
    Data de presentació: 2017
    Presentació treball a congrés
  • Yeasts associated with fermentation of spontaneous sourdoughs used by bakeries in the Barcelona area (Spain)

     Gordun, E.; Carbó, R.; del Valle, LJ.; Ginovart, M.
    International Conference on Environmental, Industrial and Applied Microbiology
    p. 147
    Data de presentació: 2017
    Presentació treball a congrés
  • Control acústico de la ebullición en depósitos de combustible en microgravedad

     Gonzalez, R.; Arias, S.; Legendre, D.; Colin, C.; Muratov, C.; Khasin, M.
    Projecte R+D+I competitiu
  • Acoustic evaluation of modular greenery noise barriers  Accés obert

     Lacasta, A.M; Peñaranda, A.; Rodriguez Cantalapiedra, I.; Auguet, C.; Burés, S.; Urrestarazu, M.
    Urban forestry and urban greening
    Vol. 20, num. December, p. 172-179
    DOI: 10.1016/j.ufug.2016.08.010
    Data de publicació: 2016-12-01
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Reentry and ectopic pacemakers emerge in a three-dimensional model for a slab of cardiac tissue with diffuse microfibrosis near the percolation threshold  Accés obert

     Alonso, S.; Weber, R.; Bär, M.
    PLoS one
    Vol. 11, num. 11, p. 1-23
    DOI: 10.1371/journal.pone.0166972
    Data de publicació: 2016-11-22
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Cinda en 100 palabras

     Giro, A.
    Data de publicació: 2016-10-31
    Capítol de llibre
  • Bubble management by means of acoustic fields

     Garcia-Sabaté, A.; Gonzalez, R.
    International Conference on Two-Phase Systems for Space and Ground Applications
    Data de presentació: 2016-09-27
    Presentació treball a congrés
  • Analysis of the characteristic lengths in the bubble and slug flow regimes generated in a capillary T-junction  Accés obert

     Arias, S.; Gonzalez, R.
    International journal of multiphase flow
    Vol. 87, p. 167-174
    DOI: 10.1016/j.ijmultiphaseflow.2016.09.011
    Data de publicació: 2016-09-20
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Modeling internal concentration gradients in cell polarity: interplay between kinases and phosphatases

     Alonso, S.
    International conference in Systems Biology
    Data de presentació: 2016-09-19
    Presentació treball a congrés
  • Onset of mechanochemical pattern formation in simple models of viscoelastic active cytoplasm

     Alonso, S.
    BCAM Workshop on Nonlinear Dynamics in Biological Systems
    p. 19
    Data de presentació: 2016-09-02
    Presentació treball a congrés
  • Pro-arrhythmic effects of cardiac contraction

     Echebarria, B.
    BCAM Workshop on Nonlinear Dynamics in Biological Systems
    p. 13
    Data de presentació: 2016-09-02
    Presentació treball a congrés
  • Development of a computational model of calcium signaling in cardiac cells at the submicron scale

     Marchena, M.; Echebarria, B.
    BCAM Workshop on Nonlinear Dynamics in Biological Systems
    p. 23-
    Data de presentació: 2016-09-01
    Presentació treball a congrés
  • Nonlinear physics of electrical wave propagation in the heart: a review  Accés obert

     Alonso, S.; Baer, M.; Echebarria, B.
    Reports on progress in physics
    Vol. 79, num. 9, p. 096601-096700
    DOI: 10.1088/0034-4885/79/9/096601
    Data de publicació: 2016-08-12
    Article en revista
    Accés al text complet
  • Calcium alternans as a critical order-disorder transition

     Alvarez-Lacalle, E.; Echebarria, B.; Spalding, J.; Shiferaw, Y.
    SIAM Conference on the Life Sciences
    Data de presentació: 2016-07-11
    Presentació treball a congrés
  • Influence of gap junction dynamics on the stability of reentrant waves in cadiac tissue  Accés obert

     Hawks, C.; Elorza, J.; Echebarria, B.; Rodriguez Cantalapiedra, I.; Peñaranda, A.; Bragard, J.
    Computing in Cardiology Annual Conference
    p. 437-440
    Data de presentació: 2016-07-07
    Presentació treball a congrés
    Accés al text complet
  • Una activitat docent per introduir la programació lineal en estudis d’Enginyeria de Biosistemes i Agroalimentària a través de problemes de dietes, planificació i produccions  Accés obert

     Blanco, M.; Ginovart, M.
    Congrès Català d'Educació Matemàtica
    p. 1-10
    Data de presentació: 2016-07
    Presentació treball a congrés
    Accés al text complet
  • Effects of vibrations applied to fluids at different gravity levels  Accés obert

     Garcia-Sabaté, A.
    Departament de Física, Universitat Politècnica de Catalunya
    Tesi doctoral
    Accés al text complet
  • New model approach for forecasting timing of weed control measures

     Izquierdo, J.; Morrisson, J.; Prats, C.; Lopez, D.
    International Weed Science Congress
    p. 62-
    Data de presentació: 2016-06-20
    Presentació treball a congrés
  • A 3D CFD numerical study of the bubble generation process into a bubble Tjunction generator and its comparison with experimental data: Part II  Accés obert

     Arias, S.; Montlaur, A.
    European Congress on Computational Methods in Applied Sciences and Engineering
    p. 1
    Data de presentació: 2016-06-08
    Presentació treball a congrés
    Accés al text complet
  • A 3D CFD numerical study of the bubble generation process into a bubble Tjunction generator and its comparison with experimental data: Part I  Accés obert

     Arias, S.; Montlaur, A.
    European Congress on Computational Methods in Applied Sciences and Engineering
    p. 772-787
    Data de presentació: 2016-06-08
    Presentació treball a congrés
    Accés al text complet